Восточная часть Эквадора расположена в окраинной части Южно-Американской платформы, докембрийский фундамент которой перекрыт слабоскладчатым чехлом палеозойских, мезозойских и кайнозойских отложений. К западу от платформы протягивается передовой прогиб Икитос, заполненный эоцен-четвертичной молассой.
Хребты Анд и притихоокеанская равнина относятся к Андской складчатой системе Восточно-Тихоокеанского подвижного пояса. Вост. Кордильера (Кордильера-Реаль) представляет собой антиклинорий, сложенный докембрийскими – нижнепалеозойскими метаморфич. породами (гнейсы, мигматиты, кристаллич. сланцы, кварциты) и гранитами, и надвинутый на осадочные морские и континентальные отложения палеозоя, мезозоя и кайнозоя, развитые восточнее.
Зап. и Вост. Кордильеры разделены внутриандийским грабеном Кито, заполненным молассами и вулканогенными образованиями палеогена и миоцена. Зап. Кордильера и Береговой хребет сложены верхнеюрско-меловым комплексом вулканич. пород, флишем верхнего мела – палеоцена и интрузиями гранитоидов мела – палеогена и неогена; отложения палеогена – миоцена залегают во внутр. впадинах Зап. Кордильеры (молассы), в Береговом хребте представлены мощной серией мор. терригенных отложений. Складчатые и интрузивные комплексы Анд частично перекрыты лавами неоген-четвертичных андезитобазальтов.